IFITM3-proteiini määrittelee vastustuskyvyn virtsovirukseen

Oireet

Dr. Linda Wakim ja hänen kollegansa laboratoriossa professori Jose Villadangos, biokemian ja molekyylibiologian ja Department of Microbiology and Immunology, uskovat ovat löytäneet uuden vihjeen siitä, miksi jotkut ihmiset selviytymään infektio paremmin kuin toiset.

Laboratorio tutkii kehon avoimissa osissa, kuten ihon ja limakalvojen, T-solujen "suojalaitteita" ja pyrkii ehkäisemään tartunnan kehittymistä. Kuten tiedetään, T-solut joissakin tapauksissa pystyvät havaitsemaan virukset ja infektoidut solut etukäteen ja tuhoamaan ne ennen kuin virus alkaa käyttää isäntäsolua lisääntymiseen.

Tutkijat havaitsivat, että nämä T-solut sisältävät IFITM3-proteiinia pinnalla, mikä tekee niistä resistenttejä virusinfektioon, mukaan lukien influenssa. Tulokset julkaistiin Nature Immunology.

"Jos opimme lisätä määrää ja kestoa elämän näiden T-solut, jotka ilmentävät proteiinia IFITM3 voimme kehittää parempia rokotteita, jotka tuottavat kestävämpiä sukupolven T-solujen, jotka voivat tarjota parhaan suojan pitkään.", Sanoi professori Villadangos.

Dr. Wakim sanoi: "Tällä hetkellä yritämme ymmärtää, miksi vain jotkut T-solut, eivät kaikki heistä, ilmaisevat tätä suojaavaa molekyyliä. He saavat todennäköisesti spesifisen signaalin sytokiinistä tai molekyylin pinnasta kudoksissa. Jos tunnistamme nämä kemialliset signaalit, voimme käyttää niitä tulevissa rokotteissa rokotteiden luomisen aikana. "

Lähde: Melbournen yliopisto

Linezolid - synteettinen antibiootti vakavia infektioita vastaan

Linezolid, linezolid - laajakirjoinen antibiootti

Tutkijat ovat löytäneet uuden antiviraalisen proteiinin

Melbournen yliopiston tutkijat ja Australia ja Walter ja Eliza Hall Institute (WEHI) ovat löytäneet uuden proteiinin, joka suojaa virusinfektioilta, mukaan lukien influenssa.

Linda Wakim ja hänen kollegansa uskovat, että heillä on ymmärrys siitä, miksi jotkut ihmiset selviytyvät paremmin infektioista kuin toiset. Laboratorio tutkii kehon pintojen - ihon ja limakalvojen - T-solujen "suojalaitteita". T-solut tunnistavat viruksella infektoidut solut ja tappaavat ne ennen kuin virus voi lisääntyä ja levitä muihin soluihin.

Tutkijat osoittivat, että nämä solut sisältävät IFITM3-proteiinia, mikä tekee niistä resistenttejä virusinfektioihin.

"Jos katsomme miten lisätä määrää ja kestoa elämän T-soluja, jotka ilmentävät IFITM3, tämä voi johtaa parempiin rokotteita edistää kestävämpien T-soluja, jotka kykenevät antamaan parhaan suojan pidemmän aikaa", - sanoo professori Villadangos.

Dr. Wakim sanoi:
"Tällä hetkellä yritämme ymmärtää, miksi jotkut T-solut tuottavat näitä suojaavia molekyylejä, mutta eivät muita. He todennäköisesti noudattavat jonkinlaista kemiallista signaalia (sytokiini tai pintamolekyyli) kudoksissa, jotka sijaitsevat, mikä aiheuttaa IFITM3: n ilmentymistä. Jos määritämme nämä kemialliset reitit, voimme sisällyttää ne tuleviin rokotteisiin. "

Mutaatiot ihmisen geeneissä, mikä lisää riskin vakavien influenssa-infektioiden kulkua

Vastaanotetut: 2015-03-14 Hyväksytyt painatukseen: 2015-07-22 Julkaistu: 2015-08-31

OI Kiselev 1, AB Komissarov 1, OS Konshina 1 #, MN Dmitrieva 1, E. G. Deeva 1, TV Sologub 1, VI Pokrovsky 2

1 FGBU "Influenssa instituutti" Venäjän terveysministeriön, Pietarin, Venäjän federaation

2 FBUN "Moskovan Venäjän federaation Rospotrebnadzorin" Epidemiologian keskusinstituutti "

# Kirjeenvaihdossa: 197376, Pietari, ul. Prof. Popova 15/17, FGBU "Influenssaatti" Venäjän terveysministeriöstä, E.mail: [email protected]

abstrakti

Järjestelmän geneettinen valvonta synnynnäisen immuunivasteen influenssainfektiolle ja geenin toiminnan tekee mahdolliseksi kehittää järjestelmä influenssan hoitoon, jossa keskitytään fenotyyppiin perustuvat mutaatiot yksilön geneettinen alttius vakava sairaus ja / tai komplikaatiota.

abstrakti

Luonnonmukainen, immuunijärjestelmä, immuunijärjestelmä, immuunijärjestelmä, eliö,

esittely

Rakenteen analyysi sairastuvuuden ja kuolleisuuden influenssaan maailmassa perustuu tutkimus ikäjakauma ja tunnistaminen riskiryhmiin [1-6]. Samaan aikaan on selvää, että sairastuvuus ja kuolleisuus riippuvat pitkälti yksittäisten populaatioiden ja etnisten ryhmien geneettisistä ominaisuuksista. Toisaalta, suora linkki sairastuvuuden influenssa c haplotyypin HLA (Human Leucocyte antigeenit), toinen - analyysin polymorfismin useita geenejä, jotka määrittävät tason virus suoja, vahvistaa, että panos yksittäisten mutaatioiden ja SNP (yhden emäksen monimuotoisuus, SNP) on Influenssan ilmaantuvuus ja kuolleisuus on huomattavasti aiemmin ajateltua [7-12]. Laaja tutkimus alalla populaatiogenetiikka ja alttius influenssa mukaan anti-epidemia toimenpiteitä eri puolilla maata tulisi suunnitella noudattaen geneettisiä ominaisuuksia väestöstä. On myös selvää, että rokotteiden kehittämisen pidettävä mielessä niiden "geneettinen" keskittyä suurten populaatioiden ja todennäköisyyttä huono vaste - kunnes sen puuttuminen - rokotuksiin ihmisille tiettyjä haplotypes HLA [11, 12]. Joka perustuu geneettisten polymorfismien analyysit, voimme sanoa, että influenssa terapiassa - yhteydessä massan sairastuvuuden ominainen Pandemioiden - on otettava huomioon mahdollinen luonteeltaan monimutkainen taudin kulkuun liittyy vika, joka immuniteetti ja antivirussuojaa. Ymmärtäminen geneettinen perusta patologian tartuntatautien, kuten influenssa, voi merkittävästi muuttua käytännössä rokotusten sekä perusteet terapian.

Tältä osin on tarpeen järjestää saatavilla olevat tiedot geenien ja geneettisten markkereiden rakenteesta, jotka ovat ominaisia ​​epäsopiviin tai patologisiin reaktioihin tapauksissa, joissa esiintyy influenssa ja siihen liittyviä infektioita.

Alla on luettelo ja geenien ominaisuudet, SNP, johon liittyy lisääntynyt herkkyys infektioon tai vakavaan sairauteen [9, 13, 14].

Genein polymorfismin rooli interferoniin indusoituvassa transmembraaniproteiinissa 3 (IFITM3) infektiopetologiassa

Geeni (IFITM3). Yksi tärkeimmistä löydöt ajanjakson edellisen pandemian ajan, voidaan pitää tunnistamiseen polymorfismin geenin IFITM3 kohortit potilailla, joilla on pandemian influenssa A (H1N1) pdm09 aiheuttaa vakavia taudin kulun, joissakin tapauksissa kuolemaan komplikaatioita (kuvio 1) [9, 13-21].

IFITM3-geeni kuuluu geeniryhmään, jonka aktiivisuus indusoituu tyypin I interferoneilla (IFN). IFITM3-proteiini viittaa transmembraanisiin proteiineihin ja sisältää kaksi transmembraanidomeeniä. Sen toiminnallinen aktiivisuus liittyy vastustuskyky kantoja A (H1N1) pdm09 ja monia muita infektioita, mukaan lukien kuume ja dengue-verenvuotokuumetta, Länsi-Niilin virus [13]. IFITM3 proteiini esiintyy eri isoformeja, ja yksi niistä, niin yleinen puuttuu N-terminaalinen domeeni (kuvio 2) [18-21]. Analyysi tästä ilmiöstä on johtanut mutaatioiden tunnistaminen on silmukointikohdalle, joka määrittää herkkyys influenssaan [19, 20].

Analyysissä vaikutusmekanismin IFITM3 paljasti, että tämä proteiini estää infektoitujen solujen (viruksen tunkeutuminen soluun) tasolla endosytoosin viruspartikkelien [22]. Myöhemmin asettaa sen rooli tukahduttamaan virusten aiheuttamien infektioiden, kuten Ebola, ihmisen immuunikatovirus tyypin I (HIV-1), C-hepatiitti, Dengue-kuume [13]. Se on myös esitetty, joka estää IFITM3 riippuvainen S-proteiini-endosytoosia Lähi-idän hengitystieoireyhtymä koronaviruksen (Lähi-idän Respiratory Syndrome, MERS) [23], mikä estää tunkeutumista viruksen geneettistä materiaalia soluun.

IFITM3-proteiinin laaja kirjo antiviraalista aktiivisuutta selittää se, että sillä on voimakas vaikutus vacuoleja (in-ATPaasi) ja endosomeja ATPaasikompleksin stabiilisuuteen. Virusten endosytoosissa tärkeä rooli on β-ATPaasin ja endosomien välinen vuorovaikutus, mikä johtaa klathriinien paikallistumiseen ja pH-arvon pienenemiseen [24]. Tämä prosessi on avainasemassa solujen infektiossa, joten se on erityisen houkutteleva terapeuttisena kohteena. On todettu, että klathriinin ja b-ATPaasin klassiset estäjät ovat tehokkaita virusten lisääntymisen estäjiä ja kuuluvat laajakirjoihin. Osoitettiin, että tähän luetteloon kuuluu Arbidol [25]. Siten Arbidolissa on havaittu toinen toimintamekanismi, joka ilmeisesti määrittää antiviraalisen aktiivisuutensa laajaan virusten joukkoon. Antiviraalisen suojauksen mekanismi ei kuitenkaan voi olla täysin perusteltu IFITM3-virusten häiriöiden mekanismeille kloatriinireitin tasolla viruspartikkeleiden internalisoimiseksi varhaisvaiheissa.

IFITM3-geenin ilmentämisen aikana voidaan muodostaa kaksi erilaista transkriptiota: täysi ja katkaistu variantti, joka koodaa proteiinisekvenssiä, josta puuttuu 21 aminohappotähteen N-terminaalinen fragmentti [21].

Yleisesti ottaen IFITM3-proteiini on viruksen lisääntymisen restriktiotekijä, joka vaikuttaa erilaisten perheiden aiheuttamien solujen resistenssin muodostumisen kautta. Mutta yksityiskohtaiset mekanismit antiviraalisen suojan muodostumiselle soluissa IFITM3-proteiinin löytämisestä huolimatta jäävät tuntemattomiksi. Useat tutkimukset [18-20] ovat osoittaneet, että hiirillä, joilla on knockout-IFITM3-geeni, influenssatartunnan kulku on vakavampi kuin eläimillä, joilla on villin tyypin tämä geeni. Ihmispopulaatiossa tunnetaan tämän geenin mutaatio - T: n korvaaminen C: llä intron I: n liitoskohdassa [18].

Suhde tähän mutaation Euroopan väestöstä aikana influenssan aiheuttama infektio viruksen A (H1N1) pdm09, ja sairaalahoitoon, joka pidettiin kriteerinä komplikaatioiden infektion [19]. Monimutkaisen influenssan ja taudin vakavan kurssin aikana sairaalassa olevat potilaat osoittivat enemmän homotsygoottisuuden esiintyvyyttä kuin IFITM3-geenin harvinainen alleeli C. SNP rs12252-C: n esiintyvyys vakavissa potilailla oli 5,3% verrattuna 0,3% Euroopan väestöön. Kiinnostavaa on, että Kiinan populaatiossa SNP rs12252-C: n esiintyvyys oli huomattavasti korkeampi. Joten jos HS-genotyypin esiintymistiheys oli keskimäärin noin 25%, potilailla, jotka kärsivät Kiinasta vakavien influenssavirtojen muodossa, HS-genotyypin esiintyminen oli 69% (kuvio 3).

Edellä olevat tulokset IFITM3-geenin alleelien taajuudesta saivat tekijät tilastollisessa datan käsittelyssä 1000 genomille [19]. Alelien esiintymistiheys vaihteli suuresti eri populaatioissa. Kuitenkin eteläisen provinssin peräisin olevista ja Itä-, Etelä- ja Keski-Kiinassa asuvien Khan-väestön keskuudessa SS-genotyypin rs12252 taajuus oli 69%. Väestön geneettisen rakenteen ja influenssan (kuolleisuuden) yksityiskohtaisen analyysin perusteella tekijät päättelevät, että HS-genotyypin korkea esiintyminen vaikuttaa influenssan epidemiologiaan Kiinassa. Itse asiassa Kiinassa esiintyy suurta influenssaepidemian esiintymistiheyttä, joka usein johtaa pandemioihin.

Yhteydessä havaittu korrelaatio genotyypin ja IFITM3 rs12252 kliininen influenssainfektion oli kiinnostavaa tutkia yksittäisten komponenttien "sytokiini myrsky" potilailla, joilla on geenivariantteihin IFITM3 [21]. Nämä tutkimukset tehtiin infektiota sairastavilla potilailla kiertävän tässä vaiheessa patogeenisen influenssa A -viruksen (H7N9). Olemme analysoineet seuraavien markkereiden "sytokiini myrsky»: MPC-1 (monosyyttikemoattraktanttiproteiini-1), IL-1β (interleukiini-1β), IL-6, IL-8, IL-10, TNF-α (tuumorinekroositekijä), IFN-y ja C-reaktiivinen proteiini [27]. Kirjoittajat tutkivat näiden proteiinien sisältöä perifeerisessä veressä. Tämän seurauksena, se havaittiin, että potilailla, joilla on CC-genotyyppi, tason synteesin ja erittymisen proteiinin MPC-1 on merkittävästi suurempi kuin potilailla, joilla on CT tai TT-genotyyppien (Fig. 3). Ja taakkaa tauti on suoraan korreloi näiden parametrien - CC-genotyyppi, ja liiallisen ei-spesifisen immuunivasteen. Lisäksi tekijät tutkimuksen sytokiinien (MIP-1α, MIP-1β, IL-1β, IL-6 ja IL-8) keuhkoissa Kuolleiden potilaiden. Todettiin, että pitoisuudet tiettyjä tulehdusta edistävien sytokiinien oli 100-1 000 kertaa suurempi keuhkoissa verrattuna ääreisveren. Siten IFITM3 rs12252 mutaatio edistää "sytokiini myrskyn."

Johtopäätöksenä IFITM3-geenin polymorfismin rooli infektiopatologiassa on huomattava, että SNP rs12252 edistää Kawasakin taudin kehittymistä - varhaiskasvatuksen vaskuliittia [15]. Tämä patologia on myös ominaista tietyille väestöryhmille Kaakkois-Aasiassa ja voi johtaa tällaiseen vakavaan komplikaatioon kuin aortan aneurysma [28]. On huomattava, että influenssa-infektio aiheuttaa vaskuliittia, mukaan lukien aivoverenkierron infektiot, ja tämä mahdollistaa influenssatartunnan vaikutuksen sydän- ja verisuonipatologian kehittymiseen.

Geenien polymorfismi, joka lisää lisätietoa influenssan infektion vakavaan kulkuun

Geneiden polymorfismin tutkiminen tartuntatautien ja heidän vakavien tautiensa ymmärtämisen kannalta on perustavanlaatuista lastenhoidon käytölle ja globaaleille epidemioille [9, 14, 17]. Geenien valikoima, joka jossain määrin määrää influenssan komplikaatioiden kehittymisen, on merkittävästi laajentunut vuosien varrella [9, 17]. Taulukossa 1 on luettelo näistä geeneistä ja niiden todennäköinen vaikutus tiettyjen toimintojen rikkomiseen influenssan ja muiden virusinfektioiden hävittämisessä.

geeni

Koodatun proteiinin toiminta

vika

linkki

Antiviraalinen suojauskerroin endosomitasolla

Intrasellulaarisen antiviraalisen suojan puute infektion varhaisessa vaiheessa (endosomit)

Pinta-aktiivinen proteiini B - keuhkovertailuainetta

Pneumosyyttien suojaus, alveolien vakavuus, hapen kulkeutuminen ja virusten ja bakteerien puhdistuma

Fc-reseptori - tarttuvan viruksen puhdistuma

Virustartunnan puuttuminen

Komplementtijärjestelmän tekijä

Infektoituneiden solujen komplementtijärjestelmän ja komplementaarisen sytolyysin toimintahäiriö

Kiihtyvyyskerroin komplementin hajoamista varten, Cromer-veriryhmäjärjestelmän antigeeni

Keuhkosuojan synnynnäisten mekanismien puute komplementaarisesta vaurioista influenssan infektiossa

Mannosi-sitova solilektiini

Vika sääntelemässä synnynnäistä koskemattomuutta

Sytokiiniriippuvaisten signalointijärjestelmien häiriö

Sytokiinien synteesin ja aktiivisuuden hallintahäiriö ("sytokiinimyrskyn mahdollinen kehitys")

Se-riippuvaisten entsyymien kompleksi

Antioksidanttijärjestelmän toimintahäiriö

Taulukko 1. Geenit, mutaatiot ja polymorfismit johtavat monimutkaiseen influenssa-infektion kulkuun

Keuhkojen pinta-aktiivisen aineen proteiineilla on tärkeimmät toiminnot paitsi hapenkuljetuksen stabiilisuuden varmistamisessa myös antibakteerisessa ja antiviraalisessa suojauksessa. Pitkän aikavälin kliiniset havainnot osoittivat, että polymorfismi koodaavien geenien pinta-proteiineja ja erityisesti proteiini B (SP-B), on keskeinen rooli alttius infektioille, kuten influenssa [29]. On myös osoitettu, että SP-B-geenin polymorfismi liittyy hengityssairauden aiheuttaman voimakkaan infektion kulkuun [30].

Tunnettua on rooli komplementtijärjestelmään tekijät bakteeri- ja virusinfektiot. Tässä suhteessa, erityistä huomiota ansaitsee tiedot roolista polymorfismin geenin C1QBP (Komplementin komponentti 1, Q alikomponentti sitova proteiini) on komplikaationa influenssa [8, 33]. C1QBP C1QBP geeni koodaa proteiinia, joka on kypsä muoto homotrimeerinä. C1QBP homotrimeeri rakenne piirre muodostuu siitä, että sillä on epäsymmetrinen jakautuminen vastaa pinnalle molekyylin. Proteiini vuorovaikutuksessa useita erilaisia ​​molekyylejä säätelyyn osallistuvan immuunijärjestelmän: CDK13 [38], HRK [39], VTN [40], NFYB [41], FOXC1 [42], DDX21, DDX50, NCL [43], SRSF1, SRSF9 [44], CDKN2A [45] - ja muita proteiineja, mukaan lukien SD93 [46]. C1QBP toiminto on vasta-aine-riippuvainen sytolyysin infektoitujen solujen komplementin aktivaation ja fagosytoosin. Proteiini mitokondrioihin kertyvän prosessissa virusinfektion ja estää riippuvainen RLR (RIG-I-kaltaiset reseptorit) signaalitransduktiota vuorovaikutuksessa antiviraalinen proteiini Mavs (Mitokondrioiden Antiviral-merkinanto-proteiinia). C1QBP proteiini liittyy aktivointiin verenhyytymiskaskadista [47]. Toiminta C1QBP on pleiotrooppista ja riippuu siitä, missä vaiheessa infektio.

CD55 (täydentävä hajoamisnopeuskerroin; DAF) on komplementin hajoamiskykyä lisäävä tekijä, Cromer-veriryhmäjärjestelmän antigeeni. DAF / CD55 suorittaa anti-inflammatorisia toimintoja, suojaa soluja täydentymisjärjestelmän aiheuttamilta vaurioilta ja myös ohjaa leukosyyttien migraatiota tulehduskohtaan [47]. DAF / CD55 ekspressoituu vaskulaarisessa endoteelissa, ääreisveren mononukleaarisissa soluissa ja epiteelisoluissa (mukaan lukien keuhkoepiteeli ja endometrium) [48]. CD55 tukahduttaa komplementtijärjestelmän komponenttien C3 ja C5 aktivoinnin [49]. Merkittävä CD55-ilmentymistaso hengitysepiteelissä korostaa keuhkojen suojaamisen merkitystä vaurioilta, jotka johtuvat komplementtijärjestelmän liiallisesta aktivoinnista. On mielenkiintoista huomata, että CD55: n ilmentymistasoa säätelevät progesteroni ja estrogeeni [50].

CDP-geenin promoottori SNP (rs2564978 genotyyppi T / T) liittyy vakavampaan influenssan A (H1N1) pdm09-influenssaan [34]. In vitro -kokemuksissa havaittiin, että solujen infektio influenssaviruksella A (H1N1) pdm09 aiheuttaa CD55-proteiinin ilmentymisen lisääntymistä. Potilailla, joilla oli genotyyppi T / T rs2564978, CD55: n taso perifeerisen veren mononukleaaristen solujen pinnalla väheni merkittävästi verrattuna C / C- ja C / T-genotyyppisiin potilaisiin [51].

Täydentämisjärjestelmän aktivaatio vaikuttaa merkittävästi keuhkokudoksen vaurioihin influenssatartunnan tapauksessa. Keuhkoissa hiirten influenssa A -viruksen (H5N1), havaittiin korkea C3, C5b-9, MBL, ja annetaan C3aR antagonisti vähentää merkittävästi tulehdusta keuhkokudoksessa [52].

Mutaatio CD55-geenin promoottori, näyttää johtavan vähenemiseen sen ilmentymisen, rikkoo synnynnäinen keuhkojen puolustusmekanismeja Komplementtivälitteisen häiriöiden influenssa infektion riski kasvaa vakavan sairauden ja kuoleman.

Ottaen huomioon ihmisgeenien polymorfismin ja niiden liittämisen vakavaan influenssatartuntaan liittyvästä ongelmasta, etualalla on selvästi etusijalle ongelma, joka liittyy syntymän immuniteetin riittämättömään vasteeseen. On tunnettua, että proinflammatoristen sytokiinien koodaavien geenien transkription aktivoituminen on tärkeä rooli monimutkaisen influenssan patogeneesissä [21].

Tässä suhteessa, erityisen kiinnostava on geneettinen ohjausjärjestelmä synnynnäisen immuunivasteen influenssainfektiolle ja toiminta osallistuvien geenien negatiiviseen säätelyyn koodaavien geenien proinflammatoristen sytokiinien. Geeni SOCS4 (vaimennin sytokiinisignaaleille 4) sijaitsee hierarkiassa geneettisen valvonnan aktivoinnin synteesin proinflammatoristen sytokiinien on yksi säännökset. [36]

Luontainen kiinnostus geneettisessä valvonta näiden prosessien osa luonnollista tekijöistä. Äskettäin havaittiin, että SOCS perheen geenien tärkeä rooli ehkäisevät epäspesifistä synnynnäisen immuunivasteen eri taudinaiheuttajia. Erityisesti se koskee pääasiassa proteiinia SOCS4 - suppressori sytokiinisignaaleille järjestelmien 4. negatiivinen säätelijä sytokiinisynteesin ohjaus, tämä proteiini kuuluu avaintekijöitä suojata liialliselta pro-inflammatorinen vaste virusinfektio. Suppressori tämän perheen proteiinien signalointireitin estää JAK / STAT, siten hallitsemaan yksiköt synnynnäisen ja adaptiivisen immuunivasteen [36].

SECISBP2 - geeni, joka koodaa entsymaattisen kompleksin (Sec insertio sekvenssin sitova proteiini 2), joka tarjoaa kytkimen rakenne selenokysteiini proteiinit [37]. Entsyymit sisältävät selenokysteiini, osa redox-järjestelmän solu suojaa happiradikaaleja. Sukupolven happiradikaalien - solujen reaktio suurin patogeenisten mikro-organismien, mukaan lukien virukset [37]. Kun läsnä on geneettisiä mutaatioita geenimonistusmäärityksessä SECISBP2 synteesi reaktiivisten happilajien johtaa lisätä solujen herkkyys insuliinille, joka esiintyy, esimerkiksi hiirillä, joilla Knockout-geenin, joka koodaa seleeniä sisältävä antioksidantti-entsyymin glutationiperoksidaasi I kliinisesti ihmisillä kuljetukseen SECISBP2 mutaatioita ilmenee Atsoospermia aksiaalinen lihasdystrofia, rikkoo proliferaation T-lymfosyyttien ja yleensä immunosuppressioon. Kantajia näistä mutaatioista on korkea lipidiperoksidaation ja oksidatiivisen DNA-vaurioita, vähentää korjaavaa potentiaalia DNA-vaurion ja telomeerien lyhentäminen. Dalmatialaistäpläisiä mutaatioiden geenissä SECISBP2 toimintahäiriö selenoproteoma kaikki [37]. Luonnollisesti tämä perinnöllinen virhe pitäisi näkyä erityisen akuutti tapauksessa flunssa, ja kehittää influenssa keuhkokuume. On tunnettua, että influenssa antioksidanttihoidon voidaan saavuttaa merkittäviä terapeuttisia vaikutuksia suhteessa helpotus myrkytyksen oireyhtymä ja sydän- ja verisuonitautien tapahtumat [52].

tulokset

Ymmärtäminen geneettinen polymorfia tiettyjen geenien ansiosta suunnata kehittämiseen systeemisen influenssan hoitoon keskittyen fenotyyppistä ilmenemismuotoja mutaatioiden perusteella esiintyvyys perinnöllinen alttius vakavia komplikaatioita influenssan geneettisissä riskiryhmissä ja väestössä.

Siitä mahdollisuudesta huolimatta laajalle levinneestä tunnistettu mutaatioita liittyvien geenien lisääntynyt alttius influenssa, on otettava huomioon, että tärkein tekijä on esittelyn tehokkuutta viruksen antigeenien väestön ryhmien kanssa eri HLA [10, 12].

Influenssan kuolleisuus kirjataan taudin akuuttiin ajanjaksoon ja yleensä epidemian huippuun ja sitten "viivästyneeksi kuolleisuudeksi" 1-3 kuukauden kuluttua sairaudesta. Tavallisesti tappava lopputulos liittyy samanaikaisiin sairauksiin, yleensä kardiovaskulaariseen patologiaan. Useimmiten se on sydänkohtaus, isku on usein kirjattu. Niinpä väestön geneettisen taustan analysoinnissa on otettava huomioon myös nämä tekijät.

kirjallisuus

1. Karpova LS, Sominina AA, Dmitrieva MN, Popovtseva NM, Stolyarova TP, Kiselev OI. Influenssapandemian vertailu Venäjällä vuosina 2009-10. seuraavien influenssa A (H1N1) pdm09 (2011-2014) epidemiat. Epidemiologia ja rokotteen ehkäisy 2014; 79 (6), 8-9.

2. Monto AS. Kausiluonteisen ja pandeemisen influenssan riski: valvontamahdollisuudet. Clin Infect Dis 2009; 48, Suppl 1, S20-5.

3. Taubenberger JK, Morens DM. 1918 Influenssi: kaikkien pandemioiden äiti. Emerg Infect Dis 2006; 12,15-22.

4. Wagner AP, McKenzie E, Robertson C, McMenamin J, Reynolds A, Murdoch H. Automaattinen kuolleisuuden seuranta Skotlannissa vuodesta 2009. Euro Surveill 2013; 18, 20451.

5. Dawood FS, Iuliano AD, Reed C, Meltzer MI, Shay DK, Cheng PY, Bandaranayake D, Breiman RF, Brooks WA, Buchy P, Feikin DR, Fowler KB, Gordon A, Hien NT, Horby P, Huang QS, Katz MA, Krishnan A, Lal R, Montgomery JM, Molbak K, Pebody R, Presanis AM, Razuri H, Steens A, Tinoco YO, Wallinga J, Yu H, Vong S, Bresee J, Widdowson MA. Arvioitu maailmanlaajuinen kuolleisuus liittyy ensimmäisten 12 kuukauden aikana 2009 pandemian influenssa A H1N1-virus ei leviä: mallinnus tutkimus. Lancet Infect Dis 2012; 12, 687 - 95.

6. Davila J, Chowell G, Borja-Aburto VH, Viboud C, Grajales Muniz C, Miller M. Merkittävää liittyvää sairastuvuutta ja kuolleisuutta kanssa -pandemiaa A / H1N1-influenssa Meksikossa, Winter 2013-2014: asteittainen Ikä Shift ja vakavuus. PLoS Curr 2014; 6.

7. Arankalle VA, Lole KS, Arya RP, Tripathy AS, Ramdasi AY, Chadha MS, Sangle SA, Kadam DB. Isännän immuunivasteen ja viruskuorman vaikutus pandemian H1N1 (2009) influenssavirusinfektion erilai- sessa tuloksessa intialaisissa potilailla. PLoS ONE 2010; 5.

8. Webb SA, Pettilä V, Seppelt I Bellomo R, Bailey M, Cooper DJ, Cretikos M, Davies AR, Finfer S, Harrigan PW, Hart GK, Howe B, Iredell JR, McArthur C, Mitchell I, Morrison S, Nichol AD, Paterson DL, Peake S, Richards B, Stephens D, Turner A Yung M. tehohoidon palveluja ja 2009 H1N1 Australiassa ja Uudessa-Seelannissa. N Engl J Med 2009; 361,1925-34.

9. Oshansky CM, Thomas PG. Ihmisen puolella influenssaa. J Leukoc Biol 2012; 92, 83-96.

10. Alexander J, Bilsel P, del Guercio MF, Marinkovic-Petrovic A, Southwood S, Stewart S, Ishioka G, Kotturi MF, Botten J, Sidney J., Newman M, Sette A. tunnistaminen laaja sitoutuminen luokan I HLA supertyyppi epitooppeja tarjota yleismaailmallinen kattavuus influenssa A -viruksesta. Hum Immunol 2010; 71, 468 - 74.

11. Hertz T, Oshansky CM, Roddam PL, DeVincenzo JP, Caniza MA, Jojic N, Mallal S, Phillips E, James I Halloran ME, Thomas PG, Corey L. HLA tähtäystehokkuutta korreloi ihmisen T-solu-vasteen suuruus ja influenssan A infektion kuolleisuus. Proc Natl Acad Sci U S A 2013; 110,13492-7.

12. Hertz T, Nolan D, James I, John M, Gaudieri S, Phillips E, Huang JC, Riadi G, Mallal S, Jojic N. Mapping maisema isäntä-patogeenin koevoluutio: HLA-luokan I sitova ja sen suhde evoluution ihmisen ja virusproteiinien suojelu. J Virol 2011; 85, 1310-21.

13. Brass AL, Huang IC, Benita Y, John SP, Krishnan MN, Feeley EM, Ryan BJ, Weyer JL, van der Weyden L, Fikrig E, Adams DJ, Xavier RJ, Farzan M, Elledge SJ. H1N1-virus, West Nile -virus ja dengue-virus. Cell 2009; 139, 1243-54.

14. Hui DS, Hayden FG. Toimituksellinen kommentti: Isäntä- ja virustekijät tulevissa influenssavirusinfektioissa. Clin Infect Dis 2014; 58, 1104 - 6.

15. Bowles NE, Arrington CB, Hirono K, Nakamura T, Ngo L, Wee YS, Ichida F, Weis JH. Interferoni-indusoidun transmembraaniproteiini-3: n rs12252-C-variantin kanssa homotsygoottiset kawasaki-taudin potilaat ovat merkittävästi todennäköisemmin kehittäneet sepelvaltimon vaurioita. Mol Genet Genomic Med 2014; 2, 356 - 61.

16. Rowley AH, Baker SC, Shulman ST, Rand KH, Tretiakova MS Perlman EJ, Garcia FL, Tajuddin NF, Fox LM, Huang JH, Ralphe JC, Takahashi K, Flatow J, Lin S, Kalelkar MB, Soriano B, Orenstein JM. Hienorakenteen immunofluoresenssitutkimukset ja RNA todisteet tukevat oletusta "uuden" virus liittyy Kawasakin tautia. J Infect Dis 2011; 203, 1021-30.

17. Horby P, Nguyen NY, Dunstan SJ, Baillie JK. Isäntägenetiikan rooli herkissä influenssissa: järjestelmällinen tarkastelu. PLoS ONE 2012; 7, e33180.

18. Everitt AR, Clare S, Pertel T, John SP, Pesu RS, Smith SE, Chin CR, Feeley EM, Sims JS, Adams DJ, Wise HM, Kane L, Goulding D, DIGARD P, Anttila V, Baillien JK, Walsh-TS, Hume DA, Palotie A, Xue Y, Colonna V, Tyler-Smith C, Dunning J, Gordon SB, Smyth RL, Openshaw PJ, Dougan G, Brass AL, Kellam s IFITM3 rajoittaa sairastuvuutta ja kuolleisuutta, jotka liittyvät influenssaan. Luonto 2012; 484, 519 - 23.

19. Zhang YH, Zhao Y, Li N, Peng YC, Giannoulatou E, Jin RH, Yan HP, Wu H, Liu JH, Liu N, Wang DY, Shu YL, Ho LP, Kellam P, McMichael A, Dong T. Interferoni-indusoidun transmembraaniproteiini-3-geneettisen muunnoksen rs12252-C liittyy vakavaan influenssaan kiinalaisilla yksilöillä. Nat Commun 2013; 4, 1418.

20. Everitt AR, Clare S, McDonald JU, Kane L, Harcourt K, Ahras M, Lall A, Hale C, Rodgers A, Young DB, Haque A, Billker O, Tregoning JS, Dougan G, Kellam s määrittely alue patogeeneistä, jotka ovat alttiita ifm3-restriktiolle käyttämällä hiukan hiukan mallia. PLoS ONE 2013; 8, e80723.

21. Wang Z, Zhang A, Wan Y, Liu X, Qiu C, Xi X, Ren Y, Wang J, Dong Y, Bao M, Li L, Zhou M, Yuan S, Sun J, Zhu Z, Chen L, li Q, Zhang Z, Zhang X, Lu S, Doherty PC, Kedzierska K, Xu J. Early hypersytokinemian liittyy interferoni aiheuttama transmembraaninen proteiini-3 toimintahäiriö ja ennustaa kohtalokas H7N9 infektio. Proc Natl Acad Sci U S A 2013; 111, 769 - 74.

22. Feeley EM, Sims JS, John SP, Chin CR, Pertel T, Chen LM, Gaiha GD, Ryan BJ, Donis RO, Elledge SJ, Brass AL. IFITM3 estää influenssa A -virusinfektion ennaltaehkäisevällä sytosolilla. PLoS Pathog 2011; 7, e1002337.

23. Wrensch F, Winkler M, Pohlmann S. IFITM, proteiinit, jotka inhiboivat MERS-koronaviruspiikkiproteiini: todisteet kolesteroliin riippumattomista mekanismeista. Virukset 2014; 6, 3683-98.

24. Wee YS, Roundy KM, Weis JJ, Weis JH. Solunsisäisen immuunivasteen interferoni-indusoituvat transmembraaniproteiinit toimivat kalvojen järjestäjinä vaikuttamalla klathriini- ja v-ATPaasin lokalisointiin ja toimintaan. Innate Immun 2012; 18, 834 - 45.

25. Blaising J, Levy PL, Polyak SJ, Stanifer M, Boulant S, Pecheur EI. Arbidoli estää viruksen pääsyn häiritsemällä klathriinista riippuvaista ihmiskauppaa. Antiviral Res 2013; 100, 215-9.

26. Cunningham F, Amode MR, Barrell D, Beal K, Billis K, Brent S, Carvalho-Silva D, Clapham P, Coates G, Fitzgerald S, Gil L, Giron CG, Gordon L, HOURLIER T, Hunt SE, Janacek SH, Johnson N, Juettemann T, Kähäri AK, Keenan S, Martin FJ, Maurel T, McLaren W, Murphy DN, Nag R, Overduin B, Parker A, Patricio M, Perry E, Pignatelli M, Riat HS, Sheppard D, Taylor K, Thormann A, Vullo A, Wilder SP, Zadissa A, Aken BL, Birney E, Harrow J, Kinsella R, Muffato M, RUFFIER M, Searle SM, Spudich G, Trevanion SJ, Yates A, Zerbino DR, Flicek P, Ensembl 2015. Nucleic Acids Res; 43, D662-9.

27. Ramirez-Martinez G, Cruz-Lagunas A, Jimenez-Alvarez L, Espinosa E, Ortiz-Quintero B, Santos-Mendoza T, Herrera MT, Canche-allas E, Mendoza C, Banales JL, Garcia-Moreno SA, Moran J, Cabello C, Orozco L, Aguilar-Delfin I, Hidalgo-Miranda A, Romero S, Suratt BT, Selman M, Zuniga J. kausiluonteinen ja pandemian H1N1 virusten aiheuttaa erilaisen ekspression SOCS-1 ja RIG-I-geenien ja sytokiinien / kemokiinin tuotanto makrofagissa. Cytokine 2013; 62, 151 - 9.

28. Mizuguchi M, Yamanouchi H, Ichiyama T, Shiomi M. Akuutti enkefalopatia, johon liittyy influenssa ja muut virusinfektiot. Acta Neurol Scand Suppl 2007; 186, 45-56.

29. KK, Zhou J, Song YQ, Hung IF, IP WC, Cheng ZS, Chan AS, Kao RY, Wu AK, Chau S, Luk WK, Ip MS, Chan KH, Yuen KY. Pinta-aktiivisen proteiinin B-geenin polymorfismi liittyy vakavaan influenssaan. Rinta 2014; 145: 1237 - 43.

30. Puthothu B, Forster J, Heinze J, Heinzmann A, Krueger M. Pinta-aktiivinen proteiini B polymorfismit liittyy vakavia RS-virus-infektio, mutta ei astma. BMC Pulm Med 2007; 7, 6.

31. Zarychanski R, Stuart TL, Kumar A, Doucette S, Elliott L, Kettner J, Plummer F. Correlates vakavan sairauden potilailla, joilla on 2009 influenssapandemiaa (H1N1) virus-infektio. CMAJ 2010; 182, 257 - 64.

32. Worgall S, Bezdicek P Kim MK, Park JG, Singh R, Christofidou-Solomidou M, Prince A Kovesdi I Schreiber AD, Crystal RG. Keuhkojen isäntien puolustus Pseudomonaksen vastustuskyvyn lisäämiseksi FcgammaRIIA cDNA: n kautta hengitysepiteeliin. J Clin Invest 1999; 104, 409-18.

33. La Ruche G, Tarantola A, Barboza P, Vaillant L, Gueguen J, Gastellu-Etchegorry M. 2009 pandemian H1N1 ja alkuperäiskansojen of the Americas ja Pacific. Euro Surveill 2009; 14.

34. Zhou J, KK, Dong H, Cheng ZS, Lau CC, Poon VK, Tuuletin YH, Song YQ, Tse H, Chan KH, Zheng BJ, Zhao GP, Yuen KY. CD55: n funktionaalinen vaihtelu lisää vuoden 2009 pandemian H1N1 influenssa A -virusinfektion vakavuutta. J Infect Dis 2012; 206, 495 - 503.

35. Zuniga J, Buendia-Roldan I, Zhao Y, Jimenez L, Torres D, Romo J, Ramirez G, Cruz A, Vargas-Alarcon G, Sheu CC, Chen F, Su L, Tager AM, Pardo A, Selman M, Christiani DC. Geneettiset muunnokset, jotka liittyvät vakavaan keuhkokuumeeseen A / H1N1-influenssatartunnalla. Eur Respir J 2011; 39, 604-10.

36. Kedzierski L, Linossi EM, Kolesnik TB, Day EB, Bird NL, Kile BT, Belz GT, Metcalf D, Nicola NA, Kedzierska K, Nicholson SE. Sytokiinisignaloinnin 4 (SOCS4) estäjä suojaa vaikeilta sytokiinimyrskiltä ja parantaa virusepuhdistusta influenssa-infektion aikana. PLoS Pathog 2014; 10, e1004134.

37. Schoenmakers E, Agostini M, Mitchell C, Schoenmakers N, Papp L, Rajanayagam O, Padidela R, Ceron-Gutierrez L, Doffinger R, PREVOSTO C, Luan J, Montano S, Lu J, Castanet M, Clemons N, Groeneveld M, Castets P, Karbaschi M, Aitken S, Dixon A, Williams J, Campi I Blount M, Burton H, Muntoni F, O'Donovan D, Dean A, Warren A, Brierley C, Baguley D, Guicheney P, Fitzgerald R, Coles A, Gaston H, Todd P, Holmgren A, Khanna KK, Cooke M, Semple R, Halsall D, Wareham N, Schwabe J, Grasso L, Beck-Peccoz P, Ogunko A, Dattani M, Gurnell M, Chatterjee K. Mutaatiot selenokysteiini insertiosekvenssi-sitovan proteiinin 2-geenin johtaa monisysteemisenä selenoproteiini puute häiriö ihmisillä. J Clin Invest 2010; 120, 4220 - 35.

38. Jopa Y, Durieux S, Escande ML, Lozano JC, Peaucellier G, Weil D, Geneviere AM. CDC2L5 ja Cdk-kaltainen kinaasi RS-domeenilla, vuorovaikutuksessa ASF / SF2: n kanssa assosioituneen proteiinin p32 kanssa ja vaikuttaa silmukointiin in vivo. J Cell Biochem 2006; 99, 890 - 904.

39. Sunayama J, Ando Y, Itoh N, Tomiyama A, Sakurada K, Sugiyama A, Kang D, Tashiro F, Gotoh Y, Kuchino Y, Kitanaka C. Fysikaaliset ja funktionaalinen vuorovaikutus BH3-ainoa proteiini, HRK ja mitokondrio huokosia muodostavan proteiini p32. Cell Death Differ 2004; 11, 771 - 81.

40. Lim BL, Reid KB, Ghebrehiwet B, Peerschke EI, Leigh LA, Preissner KT. Sitoutumisproteiini komplementtin C1q, gC1qR globulaaristen päiden kohdalle. Funktionaalinen ekspressio ja karakterisointi uutena vitronektiinisitoutumisker- roina. J Biol Chem 1996; 271, 26739 - 44.

41. Chattopadhyay C, Hawke D, Kobayashi R, Maity SN. Ihmisen p32 vuorovaikuttaa CCAAT: ää sitovan tekijän CB-alayksikön, CBF / NF-Y: n kanssa ja inhiboi CBF-välitteistä transkription aktivaatiota in vitro. Nucleic Acids Res 2004; 32, 3632 - 41.

42. Huang L, Chi J, Berry FB, Footz TK, Sharp MW, Walter MA. Ihmisen p32 on uusi FOXC1-interaktiivinen proteiini, joka säätelee FOXC1-transkriptionaalista aktiivisuutta silmäsoluissa. Invest Ophthalmol Vis Sci 2008; 49, 5243-9.

43. Yoshikawa H, Komatsu W, Hayano T, Miura Y, Homma K, Izumikawa K, Ishikawa H, Miyazawa N, Tachikawa H, Yamauchi Y, Isobe T, Takahashi N jatkaminen tekijä 2-liittyvä proteiini p32 osallistuu ribosomin biogeneesissä mukaan joka säätelee Nop52: n ja fibrillariinin sitoutumista preribosomiin partikkeleihin. Mol Cell Proteomics 2011; 10, M110 006148.

44. Petersen-Mahrt SK, Estmer C, Ohrmalm C, Matthews DA, Russell WC, Akusjarvi G. silmukoinnin tekijä liittyvän proteiinin, p32, säätelee Silmukointi estämällä ASF / SF2 RNA: n sitominen ja fosforylaatio. EMBO J 1999; 18, 1014-24.

45. Reef S, Shifman O, Oren M, Kimchi A. autophagic indusoija smARF vuorovaikutuksessa ja stabiloidaan mitokondrion p32-proteiinin. Onkogeeni 2007; 26, 6677 - 83.

46. ​​Ghebrehiwet B, Lu PD, Zhang W, Keilbaugh SA, Leigh LE, Eggleton P, Reid KB, Peerschke EI. Todiste siitä, että kaksi C1q: tä sitovaa membraaniproteiinia, gC1q-R ja cC1q-R, assosioituvat kompleksin muodostamiseksi. J Immunol 1997; 159, 1429 - 36.

47. Sakuma M, Morooka T, Wang Y, Shi C, Croce K, Gao H, strainic M, Medof ME, Simon DI. Luontainen komplementtisäädin hajoamisen kiihdytyskerroin moduloi biologisen vasteen vaskulaariseen vammaan. Arterioscler Thromb Vasc Biol 2010; 30, 1196 - 202.

48. Uhlen M, Fagerberg L, Hallstrom BM, Lindskog C, Oksvold P, Mardinoglu A, Sivertsson A, Kampf C, Sjöstedt E, Asplund A, Olsson I, Edlund K, Lundberg E, Navani S, Szigyarto CA, Odeberg J, Djureinovic D, Takanen JO, Hober S, Alm T, Edqvist PH, Berling H, Tegel H, Mulder J, Rockberg J, Nilsson P, Schwenk JM, Hamsten M, von Feilitzen K, Forsberg M, Persson L, Johansson F Zwahlen M, von Heijne G, Nielsen J, Ponten F. Proteomics. Ihmisen proteomin kudosperustainen kartta. Tiede 2015; 347, 1260419.

49. Kuttner-Kondo LA, Mitchell L, Hourcade DE, Medof ME. Aktiivisten kohteiden karakterisointi hajoamisen kiihdytyskertoimessa. J Immunol 2001; 167, 2164 - 71.

50. Nowicki B, Nowicki S. DAF terapeuttisena kohteena steroidihormoneille: vaikutukset isännän ja patogeenin vuorovaikutuksiin. Adv Exp Med Biol 2013; 735, 83-96.

51. Shang Y, Chai N, Gu Y, Ding L, Yang Y, Zhou J, Ren G, Hao X, Fan D, Wu K, Nie Y. Systemaattinen immunohistokemiallinen analyysi ilmentymisen CD46, CD55, ja CD59 paksusuolen syöpä. Arch Pathol Lab Med 2014; 138, 910-9.

52. Sun S, Zhao G, Liu C, Wu X, Guo Y, Yu H, Song H, Du L, Jiang S, Guo R, Tomlinson S, Zhou Y. inhibitio komplementtiaktivaation lievittää akuutin keuhkovaurion aiheuttama erittäin patogeeninen lintuinfluenssan H5N1-virustartunta. Am J Respir Cell Mol Biol 2013; 49, 221 - 30.

Se on kirjoitettu perheelle

Miksi tiettyjen ihmisten flunssa on banal vaiva, ja toisille kuolettava sairaus?

Asiantuntijoiden mukaan, joiden tiedot poikkeavat merkittävästi virallisista tilastoista, vuosittain Venäjällä noin kolme miljoonaa ihmistä kärsii influenssasta. Niiden kohdalla 20 000 on tappava. Miksi jotain influenssaa - banal-huonovointisuutta, mutta toisille - vakava sairaus, jolla on vakavia komplikaatioita? Yhdistyneen kuningaskunnan ja Yhdysvaltain tutkimuslaitosten virologien kansainvälinen ryhmä tuli lähelle vastausta tähän kysymykseen.

On jo pitkään tiedetty, kuka kärsii influenssasta useammin: lapset, vanhukset ja jo krooniset sairaudet ovat vaarassa. Kuitenkin se ei ole harvinaista tilanteesta, jossa vakava komplikaatioiden aiheuttama flunssa kirjaimellisesti tuo alas keski-ikäisen miehen, joka oli aiemmin erinomainen terveys. Sian sikainfluenssan H1N1 vuosina 2009-2010 tällaiset tapaukset olivat erityisen korkeat. Maailman terveysjärjestö totesi sitten, että suurin osa influenssaryhmistä kärsi keskivaikeista oireista ja ne, joilla oli vaikeuksia selviytyä sairaudesta ja jotka olivat sairaalassa, olivat vain 5-7 prosenttia. Mutta 40 prosenttia vakavista komplikaatioista kuolleista kärsivistä ihmisistä oli hyvin kallistettuja - heillä ei ollut lainkaan riskitekijöitä. Niistä, jotka kuolivat influenssa, lähes sama määrä. Toinen kummajainen: virus on tullut suhteellisen harmittomia suurimmalle osalle väestöstä Maan, jonnekin leikkaa vain sukulaisia ​​- jäsenten joko perheen. Monet epäilivät, että patogeeni-mutaatiot olivat kaiken vastuussa. Kaikki kuitenkin osoittautui eri tavalla.

Tutkijat Sanger-instituutti Britanniassa, ja Institute Ragon klo keskussairaalassa Massachusettsin Yhdysvalloissa päätti tutkia asiaa, viitaten mekanismeja synnynnäisen immuniteetin. "Kun ihmiset puhuvat immuunijärjestelmän, useimmiten on mielessään immuniteetin: vastauksena taudinaiheuttajia päästä elimistöön se tuottaa kullekin näistä vasta, koulutetaan vastaamaan niihin - kertoo immunologist tunnetun venäläisen akateemikon RAS ja RAMS Rem Petrov. - Nyt kuitenkin herätti tutkijoiden on toinen, enemmän antiikin järjestelmä koskemattomuuden, joka mahdollistaa kehon nopeasti vastaamaan loukata jonkun, jopa täysin vieras vihollinen. Luonnollisella immuniteetilla tarkoitetaan koko seuraavaa toistensa vastaista immuunireaktiota - jotkut vaiheet ovat mukana muiden jälkeen. "

Kun otetaan huomioon kansainvälinen ryhmä tiedemiehiä luonteen tutkimiseen flunssa, oli ns interferonilla indusoitavissa transmembraaniproteiiniksi IFITM3. "Kuten nimikin kertoo, proteiini immuunivaste alkaa toimia jälkeen interferoni, joka antaa signaalin infektion läsnäolon kehossa", - sanoo Rem Petrov. In vitro soluviljelmien kokeissa paljastui tärkeä tehtävä IFITM3: ssa. Kun ulkomaalainen virus menee soluun organismin, se on tämä proteiini ei salli häntä siirtyä tumaan, jossa se voi suorittaa viruksen replikaation mekanismi, ja siten estää infektion kehittymisen. Ragon-instituutin Ebraham Brass osoitti, että IFITM3 estää virusten lisääntymisen soluviljelmissä. Kuitenkin in vitro ja in vivo - itse asiassa kaksi eri maailmaa. Mikroskopin alla oleva petrimalja ei välttämättä toimi elävässä kudoksessa. Senger-instituutin Paul Kellamin mukaan tutkija onnistui lopulta selville, että IFITM3 muodostaa elimistössä ratkaisevan puolustusvoiman. Mutta ennen tätä, Kellam ja Brass joutuivat tekemään useita kokeiluja.

Ensinnäkin tutkijat päättivät testata hypoteesi laboratorioeläimillä. Tätä varten he ottivat erityiset siirtogeeniset hiiret "pois päältä" IFITM3-geenin ja konventionaalisten hiirten kontrolliryhmän kanssa. Tarttuivat molemmat ryhmät vaarattomalla matalapatogeenisella influenssaviruksella, he alkoivat odottaa tulosta. Perinteiset hiiret kärsivät infektiosta hyvin. Ne toipuivat nopeasti, lähes menettämättä painoa. Mutta siirtogeeniset hiiret olivat hyvin huonoja. "IFITM3-proteiinin puute johti ohimenevään keuhkokuumeeseen. Haitan aiheuttama vahinko muistutti paljon kuvaa, joka havaittiin vuonna 1918 ihmisten erittäin patogeenisen viruksen "espanjalaisissa" infektioissa. Kuuden päivän aikana siirtogeeniset hiiret menettivät neljänneksen painostaan ​​ja keuhkossa havaittu viruksen määrä oli kymmenen kertaa suurempi kuin normaalien hiirten. Tietenkään kukaan ei laittaisi tällaisia ​​murhattuja kokeita ihmisille. Siksi tällä hetkellä kysymys siitä, kuinka IFITM3-proteiinin koodaavan geenin hajoaminen vaikuttaa influenssan leviämiseen ihmisillä, pysyi avoimena.

Ratkaisu löydettiin, kun tutkijat päättivät mennä päinvastaisesta. Itse asiassa, jos et voi saada ryhmä ihmisiä, joilla IFITM3 proteiinin vikoja, niitä virus, niin miksi ei katsoa niitä, jotka ovat jo kärsineet flunssa epidemian aikana? Tutkijat valitsivat 53 ihmistä niiltä, ​​jotka tulivat sairaalaan sikainfluenssan pahimmilla oireilla, ja analysoivat niiden genomin. Osoitettiin, että useimmille IFITM3-proteiinin koodaava geeni oli täysin normaali. Tutkimuksen tulos oli kuitenkin edelleen vaikuttava. Loppujen lopuksi kävi ilmi, että pieni ryhmä ihmisiä, joilla on ollut flunssa hyvin vakavasti, oli jakautuminen geeni: vastaava proteiini oli lyhyempi, 21 aminohappoa, ja siten toimi kunnolla. Kaikki on suhteessa. Ne, jotka löysivät geenivirheen, olivat 5,7 prosenttia influenssaryhmän keskuudessa. Ja väestön keskuudessa tämä geneettinen vika täyttää taajuudella 0,3 prosenttia. Toisin sanoen uhrien joukossa oli kymmeniä kertoja enemmän ihmisiä, joilla oli geeni hajoaminen kuin koko väestölle. Yhteys muodostettiin. Tutkijat olisivat kuitenkin muuttuneet, jos he eivät olisi yrittäneet tarkistaa näitä tietoja.

Tätä varten he palasivat uudelleen soluviljelmiin in vitro. Tällä hetkellä se kesti vain kolme erilaista solut: ne, joilla on proteiini IFITM3 oli normaali, joiden kanssa hän oli poissa, ja ne, joissa proteiini on lyhennetty 21 aminohappoa. Kun tutkijat käynnistivät viruksen testiputkiin, tulos ei kestänyt kauan. "Normaalit" proteiinit IFITM3, kuten tavallista, välittömästi esitti puolustusmateriaalia patogeenia vastaan. Mutta tämän geenin lyhennetyt proteiinit olivat erittäin huonoja taistelijoita taistelussa influenssaa vastaan. Hänen linnoituksensa - solun ydin - he kulkivat lähes ilman taistelua, jolloin virus lisääntyisi. Kokeilun tulos oli melkein erilainen kuin mitä tehtiin soluilla, joilta puuttui tärkeä proteiini. Joten, syy vakavin komplikaatioita influenssan epidemian aikana todella voitaisiin lyhentää IFITM3.

"Tutkijat pystyivät paljastaa yksi tärkeimmistä mekanismeista infektion vastakkainasettelua", - sanoo johtaja tutkimuslaitos influenssa RAMS Oleg Kiselev. Lääketieteellisissä ja geneettisissä keskuksissa näyttää jo rakentavan potilaan riviä. Toisaalta, vaaroista ja hyödyistä rokotuksen viime vuosina paitsi sanoo laiska, toinen - flunssarokote, teemme periaatteessa on välttää vakavia komplikaatioita. Ja näyttäisi löytävän keinon tunnistaa ne, joille rokotukset ovat välttämättömiä. Asiantuntijat kuitenkin varoittavat: kunnes lopullinen selkeys on vielä kaukana. Recall numerot kokeilu: epäonnistuminen IFITM3 löytyy 5,7 prosentilla potilaista, voitti flunssa. Tämä tarkoittaa, että 94,3 prosenttia vakavista influenssan komplikaatioista on silti mysteeri. "Monimutkaisissa kokonaisuus synnynnäisen immuniteetin, tutkijat ovat vielä voineet laatia pelistä vain yksi työkalu - sanoo Rem Petrov. "Meidän on myös tarkasteltava muita immuunivasteita yksityiskohtaisesti." Kuitenkin mitä sanot, pisteet on jo kirjoitettu, ja tämä on melko paljon. "Ota toinen pieni askel kohti henkilökohtaisen lääketieteen tulevaisuuden", - sanoo vararehtori Novosibirsk State University, vastaava jäsen Venäjän tiedeakatemian Sergei Netyosov. Ja nyt voimme uneksia, että kun geneettinen analyysi halpenee ja helppokäyttöisempiä menettelyjä, lääkärit voivat helposti valita koko väestön 0,3 prosenttia niistä, joille murtuneen geenin IFITM3 flunssa on tappava. Ja suojella heitä kausiluonteisista sairauksista kaikki käytettävissä olevat keinot - myös rokotteiden avulla. Tämä lähestymistapa ei enää näytä fantastiselta.

Immuniteetti voi torjua maksasairautta

Maksa saa paitsi happi-rikasta valtimoveren maksan valtimosta, vaan myös suonesta virtaavan laskimoveren portin laskimoa. Ja tämä tarkoittaa sitä, että maksa on tärkeä elimen veren leviämisen infektioon.

Torjua infektio maksa sisältää paljon immuunijärjestelmän soluja, jotka ovat mukana havaitsemiseen ja kohtaus taudinaiheuttajien veressä. Kaikki nämä solut - osallistujille laajan koordinoidun immuunivasteen tähtääviä tartunnanaiheuttajien poistamiseksi, vetovoima lisäjoukkoja valkosoluista (leukosyyteistä) ja tuottaa signaalin vaara syntyi. Lisäksi maksa voi erottaa todella haitalliset vieraat aineet yhteisistä vieraista aineista, jotka tulevat ruokaan.
Maksassa ylläpidetään siten tasapainoa immuunivasteen tuottamisen ja sen liiallisen vasteen säätelemisen välillä, mikä tekee siitä - monien muiden toimintojen lisäksi - tärkeän elimen, joka auttaa immuunijärjestelmää. Siksi on tärkeää kiinnittää erityistä huomiota maksaan ja unohtaa sen tarve terveelliselle ravitsemukselle, vitamiineille, välttämättömille fosfolipideille ja mikroelementeille.
Maksan roolia immuunivasteen muodostumisessa, jolla pyritään suojaamaan vieraita aineita vastaan, tutkitaan edelleen. Esimerkiksi vuonna 2015 Adelaiden yliopistossa (Australia) olevat tiedemiehet selvittivät hepatiitti C -viruksen kehityksen vaimentavan geeniperheen maksa-arvon. Tutkimuksen tulokset julkaistiin vuonna 2007 Lehti biologista kemiaa.
Hepatiitti C -virus on vakava ongelma Australiassa ja muualla maailmassa, noin 223000 australialaista on tartunnan saaneella viruksen hepatiitti C: llä, joka on tartunnan saaneella verellä. Näkemätön infektio voi johtaa krooniseen sairauteen ja maksasyövään - ja molemmat edellytykset esiintyvät useammin.

Tutkijat osoittivat ensin, että virusvastaiset IFITM-proteiinit, joita oma immuunijärjestelmämme tuottaa, voivat estää hepatiitti C -virusten tunkeutumisen soluihin.
Professori Michael Beard, laboratorion johtaja patogeneesin virustautien, kommentoi: "Nyt olemme oppineet paljon siitä, miten proteiinien IFITM työtä maksassa ja miten ne tukahduttaa hepatiitti C parempi käsitys elimistön reaktio käyttöön virus, voimme kehittää uusia hoitoja: parantaa kehon reaktio tai jäljitellä sitä, jotta virukset voidaan tarkasti tuhota. "
Aikaisempi Laboratoriokokeet ovat osoittaneet, että proteiinit IFITM1, IFITM2 ja IFITM3 pystyvät tukahduttaa aiheuttama infektio erilaisten virusten, mukaan lukien hepatiitti C -viruksen, mutta näiden proteiinien osuutta pysyi mysteeri viime aikoihin asti, tukahduttamiseen infektio.
Professori Bird ja jatko-opiskelija Sumud Narayana tutkivat näiden proteiinien vaikutusta hepatiitti C -viruksiin maksasoluissa. He onnistuivat osoittamaan, että maksasolut, jotka syntetisoivat suuren määrän IFITM-proteiineja, ovat resistenttejä virusinfektioille, koska ne eivät salli sen pääsyn sisälle.
Tutkijat ovat osoittaneet, että näiden proteiinien ja viruksen välinen vuorovaikutus yrittää päästä soluun. Ilmeisesti virusten torjumiseksi proteiinit toimivat yhdessä. Nämä tiedot avaavat uusia tapoja estää viruksen hepatiitti.

Interferonilla indusoitu transmembraaniproteiini 3

IFITM3

Merkintöjen tulos: 5 out of 5

Merkintätulos antaa heuristisen mittauksen UniProtKB-merkinnän tai proteomin merkintäsisällöstä. Tämä pisteet ei voi käytetään merkintöjen tarkkuuden mittana.

- Kokeellinen näyttö proteiinitasolla i

Tämä osoittaa sellaisen näytön tyypin, joka tukee proteiinin olemassaoloa. Huomaa, että "proteiinien olemassaolo" ei anna tietoja näytettävien sekvenssien / tarkkuuksien tarkkuudesta tai oikeellisuudesta.

Voit tarkastella sisältöä valitsemalla vasemmalla olevan osan.

Tässä osiossa on hyödyllistä tietoa proteiinista, lähinnä biologisesta tietämyksestä.

Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

Gene Ontology (GO) -hankkeessa on joukko hierarkkisia kontrolloituja sanastoja, jotka on jaettu kolmeen luokkaan:

GO - Biologinen prosessi i

  • puolustusvastaus virukseen Lähde: UniProtKB

Suoramäärityksestä puuttuu

Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

Suoramäärityksestä i

  • 21478870
  • immuunivaste Lähde: ProtInc

    Jäljitettävän tekijän lausunto

    Käytetään tietoja artikkeleista, joissa alkuperäiset kokeet ovat jäljitettävissä tämän artikkelin kautta ja myös tietoja oppikirjoista tai sanakirjoista.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Suoramäärityksestä i

    • 21253575
  • viruksen vastaus Lähde: UniProtKB

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    UniProtKB Avainsanat: hallittu sanasto, jolla on hierarkkinen rakenne. Avainsanat tiivistävät UniProtKB-merkinnän sisällön ja helpottavat kiinnostavien proteiinien etsimistä.

    Entsyymi- ja polkujen tietokannat

    Reactome - biologisten reittien ja prosessien tietopohja

    Proteiiniperhe / ryhmätietokannat

    Liikenteen luokitustietokanta

    Tässä osiossa on tietoja proteiineista ja geenien nimistä ja synonyymeistä sekä organismin, joka on proteiinisekvenssin lähde.

    nimet Taksonomia i

    Nimet ja taksonomia -osiossa on tyhjentävä luettelo kaikista proteiinin nimistä, jotka ovat yleisesti vanhentuneita, jotta proteiinin yksiselitteinen tunnistaminen voidaan tehdä.

    Proteiinien nimet i

    Nimet ja taksonomia -osiossa on tämän nimikkeen kohdat, jotka kuvaavat geenin tai niiden proteiinisekvenssien (-koodien) koodia. Neljä erillistä rahakkeita on olemassa: 'Nimi', 'Synonyymit', 'Ordered locus names' ja 'ORF names'.

    Nimien ja taksonomia -osan tämän osan alaosassa annetaan tietoa sen proteiinisekvenssin lähteestä peräisin olevan organismin nimiin.

    Nimien ja taksonomia -osan tämän osan alalaidassa on NCBI: n proteiinin lähteelle antama yksilöllinen tunniste. Tätä kutsutaan "taksonomiseksi tunnistimeksi" tai "taxiksi".

    Taksonominen tunniste i

    Nimet ja taksonomia tässä osassa sisältää lähdeorganismin luokitellun hierarkkisen luokituksen. Se on solmujen luettelo, koska ne esiintyvät taksonomisessa puussa, ja yleisempi ryhmittymä luetellaan ensin.

    Taksonominen linja i

    Nimien ja taksonomian tämä osa on osa proteomi, ts. joukosta neroja on kokonaan sekvensoitu.

    UniProt-proteomi voi koostua useista komponenteista.
    Komponentin nimi viittaa proteiineja koodaavaan genomiseen komponenttiin.
    Nämä vaihtelevat yhdestä komponentista, kuten virusten genomista useisiin komponentteihin, kuten eukaryoottisten kromosomien tapauksessa. Ne voivat myös edustaa erilaisia ​​vaiheita genomiprojektissa, ja ne sisältävät komponentteja, kuten contigs, scaffolds tai Whole Genome Shotgun (WGS) master-tietueita.

    Komponentti i: Kromosomi 11

  • Organismikohtaiset tietokannat

    Eukaryoottisten patogeenien tietokannan resurssit

    Ihmisen geeninimikkeistön tietokanta

    Online Mendelian perintö Man (OMIM)

    neXtProt; ihmisen proteiinin tietämysalusta

    Tässä osiossa on tietoja solun kypsän proteiinin sijainnista ja topologiasta.

    Solunsisäinen sijainti i

    Solunulkoinen alue tai erittää sytosolissa Plasmamembraanin Cytoskeleton lysosomiin endosomissa Peroksisomien ER Golgin laitteeseen Nucleus Mitochondrion Manuaalinen annotointi Automaattinen laskennallinen väite Graphics Christian Stolte; Lähde: VARAUKSET

    Plasmamembraani
    lysosomitoiminnan
    endosomista
    endosomista
    • myöhäinen endosomikalvo Lähde: UniProtKB-SubCell
  • lysosomitoiminnan
    • lysosomaalikalvo Lähde: UniProtKB-SubCell
  • Plasma-kalvo
    • plasmamembraani Lähde: UniProtKB

    Suoramäärityksestä puuttuu

    Käytetään ilmaisemaan suoran määrityksen GO-termillä osoitettua toimintaa, prosessia tai komponenttia varten.

    Lisätietoja GO-todisteiden koodausoppaasta

    Muut paikat
    • kalvon kiinteä komponentti Lähde: UniProtKB-KW

    topologia

    Subcellular location -osiossa tämä osa kuvaa sub-cellulaarista osastoa, jossa esiintyy membraaniin ulottuvan proteiinin ei-membraanialue.

    Topologinen alue i

    "Subcellular location" -osiossa tämä osa kuvaa alueen laajuutta.

    Subcellular location -osiossa tämä osa kuvaa sub-cellulaarista osastoa, jossa esiintyy membraaniin ulottuvan proteiinin ei-membraanialue.

    Topologinen alue i

    Subcellular location -osiossa tämä osa kuvaa proteiinin membraanipitoisen alueen laajuutta. Se merkitsee sekä alfa-kierteisten transmembraanialueiden että beta-barrelin transmembraaniproteiinien membraanipituisten alueiden läsnäoloa.

    Subcellular location -osiossa tämä osa kuvaa sub-cellulaarista osastoa, jossa esiintyy membraaniin ulottuvan proteiinin ei-membraanialue.

    Topologinen alue i

    UniProtKB Avainsanat: hallittu sanasto, jolla on hierarkkinen rakenne. Avainsanat tiivistävät UniProtKB-merkinnän sisällön ja helpottavat kiinnostavien proteiinien etsimistä.

    Avainsanat - Solukomponentti i

    Tässä osiossa on tietoja proteiinin liittyvistä taudeista ja fenotyypeistä.

    patologia Biotech i

    Organismikohtaiset tietokannat

    MalaCardsin ihmisen taudin tietokanta

    Online Mendelian perintö Man (OMIM)

    Farmakogeneettinen ja farmakogenomeettinen tietokanta

    Polymorfismi ja mutaatiotietokannat

    BioMuta-curatoitu yhden nukleotidivariation ja tautien yhdistämis -tietokanta

    Taudin mutaatioiden (DMDM)

    Tässä jaksossa kuvataan posttranslationaaliset muutokset (PTM) ja / tai käsittelytapahtumat.

    PTM / käsittely i

    Molekyylien käsittely

    "PTM / Processing" -osan tämän osan kappaleessa kuvataan polypeptidiketjun laajuus kypsässä proteiinissa käsittelyn jälkeen.

    Ketju i PRO_0000153729

    Aminohappomuutokset

    Tämän PTM / käsittely -osan tämän osan on kuvattu disulfidisidosten solunsisäisiä ristikytkejä tai niiden suotoventtiilejä, jotka on merkitty "disulfidiin sidos "alakohta.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    PTM / käsittely -osan tämän osan momentissa määritetään kovalenttisesti kiinnittyneiden lipidiryhmien sijainti ja tyyppi.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    PTM / käsittely -osan tämän osan momentissa määritetään kovalenttisesti kiinnittyneiden lipidiryhmien sijainti ja tyyppi.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    Tämä momentti PTM / Processing osassa kuvataan kovalenttisia sidoksia eri muodostuu kahden proteiinien (ketjujen välisten) tai kahden osan samaa proteiinia (ketjunsisäisiä ristisidosten), lukuun ottamatta disulfidisidokset, joihin on merkitty, että 'disulfidin sidos "alakohta.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    Tämä momentti PTM / Processing osassa kuvataan kovalenttisia sidoksia eri muodostuu kahden proteiinien (ketjujen välisten) tai kahden osan samaa proteiinia (ketjunsisäisiä ristisidosten), lukuun ottamatta disulfidisidokset, joihin on merkitty, että 'disulfidin sidos "alakohta.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    Tämä momentti PTM / Processing osassa kuvataan kovalenttisia sidoksia eri muodostuu kahden proteiinien (ketjujen välisten) tai kahden osan samaa proteiinia (ketjunsisäisiä ristisidosten), lukuun ottamatta disulfidisidokset, joihin on merkitty, että 'disulfidin sidos "alakohta.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    PTM / käsittely -osan tämän osan momentissa määritetään kovalenttisesti kiinnittyneiden lipidiryhmien sijainti ja tyyppi.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    PTM / prosessointiosaston tässä osassa kuvataan posttranslationaaliset modifikaatiot (PTM: t). Tämä alakohta täydentää informaatio annetaan sekvenssitasolla. paikkakohtaisia ​​tietoja ei ole vielä saatavilla.

    Posttranslationaalinen modifikaatio i

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    UniProtKB Avainsanat: hallittu sanasto, jolla on hierarkkinen rakenne. Avainsanat tiivistävät UniProtKB-merkinnän sisällön ja helpottavat kiinnostavien proteiinien etsimistä.

    Avainsanat - PTM i

    Proteomiset tietokannat

    Encyclopedia of Proteome Dynamics

    PaxDb, tietokanta proteiini-runsauden keskiarvoista kaikilla kolmella elämänalueella

    PRomeomics ID Entifications -tietokanta

    Top Down Proteomics -konsortio

    PTM-tietokannoista

    IPTMnet integroitu resurssi PTM: ita järjestelmien biologiaan

    Kokonaisresurssi ihmisen, hiiren ja rotan proteiinin jälkeisen translaation modifikaatioiden (PTM: t) tutkimiseen.

    SwissPalm-tietokanta S-palmitoylaatiotapahtumista

    Tässä osiossa on tietoja geenin ilmentämisestä mRNA- tai proteiinitasolla soluissa monisoluisten organismien kudoksissa.

    Tämä momentti on 'Expression' osa ilmoittaa kokeellisesti todistettu vaikutuksia induktorien ja repressorien (yleensä kemiallisia yhdisteitä tai ympäristötekijöiden) tasolla proteiinin (tai mRNA: n) ilmentymisen (up-regulation, alas-säätely, konstitutiivinen ilmentyminen).

    Geenien ilmentymistiedostot

    Bgee dataBase for Gene Expression Evolution

    CleanEx-tietokanta geenien ilmentämisprofiileista

    ExpressionAtlas, Differential ja Baseline Expression

    Genevisoitu hakuportaali normalisoiduille ja kuritetuille ilmentymistiedoille Genevestigatorilta

    Organismikohtaiset tietokannat

    Ihmisen proteiinin atlas

    Tämä osio sisältää tietoa proteiinin kvaternäärisestä rakenteesta ja vuorovaikutuksesta muiden proteiinien tai proteiinikompleksien kanssa.

    Tämä momentti on 'Interaction' osiossa on tietoja proteiinin kvaternaarinen rakenne ja vuorovaikutus (t) muiden proteiinien tai proteiinikompleksien (lukuun ottamatta fysiologinen reseptori-ligandi-vuorovaikutuksia, jotka selityksin, että 'toiminto' -osiossa).

    Osayksikkörakenne i

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    "Vuorovaikutus-osion tämä osa sisältää tietoja binaarisista proteiini-proteiinien vuorovaikutuksista. Tässä osiossa esitetyt tiedot ovat IntAct-tietokannasta automaattisesti johdettujen binääriyhteyksien laadullinen suodatettu osajoukko. Se päivitetään kuukausittain. Jokainen binääriyhteys näytetään erillisellä rivillä.

    Binaariset vuorovaikutukset i

    Proteiini-proteiinin tietoliikennetietokannat

    Interaktiotietokantojen biologinen yleinen arkisto (BioGrid)

    Proteiinin vuorovaikutuksen tietokanta ja analysointijärjestelmä

    Molekyylinen INTeraction-tietokanta

    STRING: toiminnalliset proteiinin assosiointiverkot

    Tässä osiossa on tietoja proteiinin tertiäärisestä ja toissijaisesta rakenteesta.

    3D-rakenne-tietokannat

    Proteiinimalliportaalin PSI-Luonnonrakennetekniikan tietopohja

    Vertailevan proteiinin rakenteen tietokanta

    MobiDB: proteiinihäiriön ja liikkuvuusmerkintöjen tietokanta

    Tässä osiossa on tietoja sekvenssin samankaltaisuudesta proteiinien ja proteiinien muiden proteiinien ja domeenien kanssa.

    perhe Verkkotunnukset i

    alue

    "Perhe- ja verkkotunnukset" -osiossa tämä osa kuvaa sitä mielenkiintoista aluetta, jota ei voida kuvata muissa alakohteissa.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    "Perhe- ja verkkotunnukset" -osiossa tämä osa kuvaa sitä mielenkiintoista aluetta, jota ei voida kuvata muissa alakohteissa.

    Käsikirjoitetut tiedot, joille on julkaistu kokeellista näyttöä.

    Manuaalinen väite, joka perustuu kokeeseen i

    Tämän ryhmän "Perhe- ja verkkotunnukset" -osiossa on tietoa sekvenssin samankaltaisuudesta muiden proteiinien kanssa.

    Sekvenssin samankaltaisuudet i

    UniProtKB Avainsanat: hallittu sanasto, jolla on hierarkkinen rakenne. Avainsanat tiivistävät UniProtKB-merkinnän sisällön ja helpottavat kiinnostavien proteiinien etsimistä.

    Avainsanat - Domain i

    Phylogenomiset tietokannat

    geenien evolutiivinen genealogia: ei-valvottuja ortologisia ryhmiä

    Homogeenisten geenien HOGENOM-tietokanta täysin järjestetyistä organismeista

    Homologisten selkärankaisten geenien HOVERGEN-tietokanta

    InParanoid: Eukaryoottiset ortologiset ryhmät

    KEGG-ortologia (KO)

    Ortologien tunnistaminen täydellisistä genomitiedoista

    Ortologisten ryhmien tietokanta

    Tietokanta geenifylogeenien täydellisistä kokoelmista

    TreeFam-tietokanta eläinten geenipuista

    Perhe- ja verkkotunnuksen tietokannat

    Proteiiniperheiden, verkkotunnusten ja toiminnallisten sivustojen integroitu resurssi

    Pfam-proteiinin verkkotunnuksen tietokanta

    Tämä osio näyttää oletuksena kanonisen proteiinisekvenssin ja pyynnöstä kaikki merkinnässä kuvatut isoformit. Se sisältää myös sekvenssiin (-järjestelmiin) liittyviä tietoja, mukaan lukien pituus ja molekyylipaino.

    Tämän osion jakson aliohjelma määrittää oletusarvoisesti merkinnän olevan täydellinen tai ei.

    Sekvenssin tila i: Täydellinen.

    Tarkistussumma on redundanssin muoto. Se on hyödyllinen seurannan järjestyspäivityksille.

    On huomattava, että vaikka teoriassa kahdella eri sekvenssillä voisi olla sama tarkistussumman arvo, todennäköisyys siitä, että tämä tapahtuisi, on erittäin pieni.

    UniProtKB voi kuitenkin sisältää merkintöjä, joilla on samanlaiset sekvenssit useiden geenien (paralogien) tapauksessa.

    Tarkistussumma on yhtä kuin sekvenssin 64-bittinen Cyclic Redundancy Check arvo (CRC64) käyttäen generaattoripolynomin: x 64 + x 4 + x 3 + x + 1. Algoritmi on kuvattu ISO 3309-standardin.

  • Edellinen Artikkeli

    Kipu maksassa

    Seuraava Artikkeli

    Neutrofiilit: normaali